W 1240 roku, gdy najemnicy cesarza Fryderyka II wdarli się do klasztoru San Damiano, św. Klara modliła się z Najświętszym Sakramentem w dłoniach. Napastnicy odstąpili, a Asyż ocalał.

W 1240 roku nad Asyżem zawisło poważne niebezpieczeństwo. Cesarz Fryderyk II z dynastii Hohenstaufów, pozostający w ostrym konflikcie z papiestwem, prowadził wojnę w środkowych Włoszech, a w jego armii służyło wielu saraceńskich najemników. Oddziały te bez większego trudu wdarły się do klasztoru San Damiano, położonego poniżej miasta, poza jego murami, gdzie żyła św. Klara wraz ze swoimi siostrami.

Klara, choć – jak przyznaje jej biograf – sama była przerażona, nie uciekła. Wzięła w dłonie naczynie, w którym przechowywano Eucharystię, i zaczęła się modlić za wspólnotę i za miasto. Wtedy z wnętrza naczynia rozległ się głos podobny do głosu dziecka, który zapewnił siostry o nieustannej opiece: „Ja zawsze będę was strzegł”. Gdy Klara prosiła także za Asyż, usłyszała, że miasto czekają trudne chwile, ale dzięki Bożej obronie wyjdzie z nich bez szwanku.

Najemników ogarnął nagły lęk – przerwali oblężenie i wycofali się, a klasztor i miasto ocalały. Relację o tych wydarzeniach przekazał Tomasz z Celano w XIV rozdziale „Legendy o św. Klarze Dziewicy”. Obraz świętej, która z Najświętszym Sakramentem w rękach powstrzymuje napastników, stał się odtąd stałym motywem jej ikonografii. Sięgali po niego m.in. Giuseppe Cesari, którego płótno „Święta Klara i oblężenie Asyżu” przechowuje petersburski Ermitaż, autor ryciny z 1587 roku Enrico de Vroom, a także twórcy ikony z bazyliki św. Klary w Asyżu.

Legenda nazywa napastników Saracenami – tym słowem średniowieczne źródła określały muzułmanów. Byli to żołnierze na żołdzie cesarza, który osiedlił muzułmańskich poddanych z Sycylii w apulijskiej Lucerze i wcielał ich do swojego wojska. Opowieść odzwierciedla perspektywę XIII-wiecznego autora, a samo wydarzenie było epizodem wojny między cesarzem a papiestwem, nie zaś sporu religijnego z islamem.

Wydarzenie z 1240 roku nie pozostawiło relikwii w ścisłym sensie. Jego pamiątką są miejsca związane ze świętą: klasztor San Damiano, do którego wciąż przybywają pielgrzymi, oraz bazylika św. Klary w Asyżu, gdzie w urnie spoczywa jej ciało.